Chi cục Kiểm lâm là đơn vị trực thuộc Sở Nông nghiệp và Môi trường Thành phố Hồ Chí Minh theo Quyết định số 1135/QĐ-UBND ngày 30 tháng 8 năm 2025 của Ủy ban nhân dân Thành phố về Tổ chức lại Chi cục Kiểm lâm Thành phố Hồ Chí Minh trực thuộc Sở Nông nghiệp và Môi trường Thành phố Hồ Chí Minh trên cơ sở hợp nhất Chi cục Kiểm lâm Thành phố Hồ Chí Minh, Chi cục Kiểm lâm tỉnh Bình Dương và Chi cục Kiểm lâm tỉnh Bà Rịa - Vũng Tàu; và được sửa đổi, bổ sung một số điều tại Quyết định số 1225/QĐ-UBND của Ủy ban nhân dân Thành phố về tổ chức lại đơn vị hành chính thuộc Sở Nông nghiệp và Môi trường Thành phố Hồ Chí Minh; Quyết định số 2939/QĐ-UBND ngày 28/11/2025 của Ủy ban nhân dân thành phố Hồ Chí Minh về thành lập Hạt Kiểm lâm rừng đặc dụng Vườn quốc gia Côn Đảo trực thuộc Ban Quản lý Vườn quốc gia Côn Đảo